Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms