Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSPNQ9HAW4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms