Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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