Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms