Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF4Q9BUZ4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms