Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TINF2Q9BSI4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TINF2Q9BSI4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TINF2Q9BSI4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TINF2Q9BSI4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TINF2Q9BSI4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms