Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LPIN3Q9BQK8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms