Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms