Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC7Q96M83 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms