Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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UBE2E2Q96LR5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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UBE2E2Q96LR5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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UBE2E2Q96LR5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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UBE2E2Q96LR5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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UBE2E2Q96LR5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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UBE2E2Q96LR5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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UBE2E2Q96LR5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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UBE2E2Q96LR5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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UBE2E2Q96LR5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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