Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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