Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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EP400Q96L91 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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EP400Q96L91 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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EP400Q96L91 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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EP400Q96L91 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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EP400Q96L91 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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EP400Q96L91 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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EP400Q96L91 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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EP400Q96L91 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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EP400Q96L91 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EP400Q96L91 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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