Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms