Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG4Q92954 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms