Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms