Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMGNT2Q8NAT1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMGNT2Q8NAT1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms