Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTL3Q8N8U3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms