Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00612Q8N6U2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms