Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC117Q8IWD4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms