Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERC6Q8IVU3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERC6Q8IVU3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms