Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms