Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms