Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms