Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HES3Q5TGS1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms