Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms