Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms