Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms