Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms