Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IMPG1Q17R60 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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