Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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