Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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