Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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EXT1Q16394 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXT1Q16394 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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