Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCD2Q16342 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms