Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS72Q15906 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
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