Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SHBQ15464 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHBQ15464 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms