Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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UBE3CQ15386 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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UBE3CQ15386 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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UBE3CQ15386 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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UBE3CQ15386 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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UBE3CQ15386 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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