Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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NECTIN1Q15223 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NECTIN1Q15223 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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