Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN2CQ14957 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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GRIN2CQ14957 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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GRIN2CQ14957 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIN2CQ14957 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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