Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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