Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms