Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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