Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD4Q13485 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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