Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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