Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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