Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN2AQ12879 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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