Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A2Q05940 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms