Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AL035658.1-201ENST00000415054 357 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC002076.1-201ENST00000435257 527 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 FBXW7-212ENST00000604872 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 LINC02474-202ENST00000441160 1148 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC096536.1-203ENST00000455380 515 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ZNF365-211ENST00000614806 877 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 CYTOR-202ENST00000409054 1096 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB1Q02641 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms