Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms