Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RANGAP1P46060 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms