Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCAMP43121 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCAMP43121 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCAMP43121 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCAMP43121 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCAMP43121 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCAMP43121 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCAMP43121 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms